Żółwie są zwierzętami jajorodnymi, a w zależności od wielkości samicy znosi od 2 do 100 jaj, które są podobne do ptasich. Mogą być pokryte skorupką wapienną, ale nie można ich obracać ani poruszać, gdyż mogłoby to naruszyć strukturę jajka w środku.
Zazwyczaj samica składa jaja do przez nią wykopanego dołu, później ostrożnie zasypując go i chowając przed intruzami. Gdy ta czynność się odbędzie, samica wraca do morza, i nie interesuje się ich losem. Jaja zakopane w ciepłym piasku są inkubowane. Żółwie lądowe na miejsce złożenia jaj wybierają najczęściej pagórki gdzie najmocniej świeci słońce.
Morskie odmiany żółwi często gromadami wychodzą aby składać jaja, najczęściej zdarza się iż w celu złożenia jaj, samica rok po roku powraca na tę samą plażę, a nawet w to samo miejsce w którym wykluła się 20-30 lat temu. Aby dotrzeć do takiego miejsca i tam złożyć jaja, niektóre żółwie podejmują bardzo dalekie wyprawy, wynoszące niekiedy tysiąc kilometrów lub więcej, a z pomocą w czasie tej drogi idą im ich węch oraz układ gwiazd na niebie.
Dzięki węchowi żółwie potrafią wyczuć znajomą plażę z odległości nawet kilkuset kilometrów. Co ciekawe, płeć mającego się wykluć żółwia jest zależna od temperatury w jakiej się inkubowało. Jaja inkubowane w sztucznych warunkach, z wysoką temperaturą dawały samice, a w niskiej rodziły się samce. W warunkach wolnej przyrody, gdzie temperatura jest zmienna, szanse na to iż młode osobniki będą miały określoną pleć również ulegają zmianie, a w czasie gdy nastąpi np.: wyjątkowo ciepły lub zimny sezon z jaj mogą wykluć się żółwie tej samej płci.
Zaraz po wykluciu się małego żółwika z jaja, wygląda on niemal tak samo jak swój rodzic. Na końcu pyska ma tzw. ząb jajowy, który posłużył mu do rozerwania powłoki jaja. Wyrostek ten odpada po kilku tygodniach. Istnieją dowody na to iż olbrzymi żółw z Birmy ochrania miejsce w którym złożył jaja. Istnieją przypuszczenia iż samica może odganiać drapieżniki chcące dobrać się do jaj przez nią złożonych.
Za to samica żółwia miękkoskórnego jest na tyle sprytna iż składa jaja na piaszczystych miejscach gdzie zakładają swoje gniazda krokodyle nilowe, znane z tego iż chronią swoich gniazd. W ten sposób chronią również miejsca gdzie żółwica złożyła swoje jaja.